AAK Manggala adalah bentuk realisasi gagasan Yayasan Manggala dalam keikutsertaannya mengantisipasi laju perkembangan pendidikan kesehatan, khususnya pendidikan Analis Kesehatan. Akademi Analis Kesehatan Manggala Yogyakarta berdiri dengan SK Menkes RI No.HK.00.06.1.3.33.61 dan SK Mendiknas No.240/D/O/2006 serta terakreditasi B berdasarkan SK Menteri kesehatan RI No. HK.06.01/III/3/02435/2011.

Mengingat -persaingan dalam dunia kerja dan kualifikasi yang semakin tinggi, maka mutlak dituntut untuk mencetak tenaga yang profesional di bidangnya. Tenaga Ahli Madya Teknologi Laboratorium Medik diharapkan dapat menjembatani pelayanan kesehatan di bidang laboratorium kesehatan. Suatu program pelayanan kesehatan yang juga didambakan oleh masyarakat umum, di mana di dalamnya terkait erat pelayanan medis.